Neue Tumor-sampling-Methode deutlich verbessert Gentests für Krebs-Behandlung

Eine ganzheitliche Tumor-sampling-Methode, die genauer erkennt, genetische Veränderungen in Tumoren, die sind entscheidend dafür, dass die Behandlung individuell auf jeden einzelnen Patienten, entwickelt von Forschern der Crick, Roche und Die Royal Marsden NHS Foundation Trust und veröffentlicht in Cell Reports.

Heute, um zu helfen ärzte wählen Sie die Behandlungsmöglichkeiten für Krebspatienten, eine Probe aus Ihrem Tumor kann die DNA sequenziert. Dieses soll die Mutationen in der DNA, was bedeutet, der Tumor ist entweder anfällig oder resistent gegen eine bestimmte Behandlung. Die Ergebnisse dieses Tests haben daher erhebliche Auswirkungen auf die Behandlungsmöglichkeiten und den Patienten die Prognose.

Aber die Genetik von Tumoren sind Komplex, weil Sie oft aus verschiedenen Gruppen von Zellen, die sich genetisch und sitzen in verschiedenen teilen des Tumors.

Aktuelle Methoden zur Probenahme verpassen kann, diese genetische Vielfalt auf, weil diese Gewebe aus einem kleinen Ort in den Tumor. Im Alltag, im Durchschnitt, nur fünf auf eine million Zellen aus dem Tumor (0.0005%) getestet. Dies bedeutet, dass ärzte Behandlungsentscheidungen basierend auf möglicherweise unvollständige Informationen, was dazu führen kann, Patienten, die möglicherweise nicht auf die Therapien, die Ihnen die höchsten Chancen zu überleben.

Zunächst, das Konzept der verbesserte sampling getestet wurde bei Lungenkrebs und Krebs der Harnblase, wo in einer simulation die verbesserte sampling reduziert misclassification Tarife bei der Entscheidung, ob ein patient geeignet war für die Immuntherapie von 20% auf 2% und von 52% auf 4% beziehungsweise, wenn im Vergleich zu aktuellen Methoden.

Basierend auf dieser Erkenntnis entwickelten Sie eine Technik namens Vertreter der Sequenzierung, die baut ein genaueres Bild von der Tumor-DNA. Dies funktioniert, indem man die Mehrheit der Tumor entfernt bei der Operation—Gewebe, ist derzeit nicht probiert und wird routinemäßig verworfen—und Misch es so, dass die Zellen aus unterschiedlichen Bereichen des Tumors sind gleichmäßiger verteilt. Eine Stichprobe ist dann aus dieser Mischung werden die DNA sequenziert.

Die Forscher testeten diese neue Methode bei 12 Patienten mit Nieren -, Brust -, Dickdarm -, Lungen-oder Hautkrebs. Vergleich der neuen und aktuellen Methoden fanden Sie heraus, dass Vertreter der Sequenzierung gab weit mehr konsistente Ergebnisse, als es vermeidet, den bias zu betrachten, nur ein kleiner Teil der Tumor-Gewebe. Stattdessen wird die neue Methode in der Lage ist zum erfassen von Informationen aus einem gut gemischten Darstellung des gesamten Tumors, was bedeutet, viel mehr Daten gesammelt werden, die auch von besserer Qualität. Als Analogie, der neue test dauert einen höheren Standpunkt und der ist mehr wie eine Polizei-Suche mit einem Hubschrauber, eher als die Verfolgung einer kriminellen nur von einer Stelle auf dem Boden.

Die Methode, die entwickelt wurde in Zusammenarbeit mit Forschern von der Crick, Roche Diagnostics und Dem Royal Marsden und veröffentlicht in Cell Reports wird weiter getestet bei 500 Tumoren im Royal Marsden in London, um weiter zu etablieren, Ihre Machbarkeit und Nützlichkeit. Die Forscher hoffen, dass nach den erfolgreichen Ergebnissen, es wird ausgerollt weiter.

„Durch die Ausstattung mit ärzten genauere Informationen über einen Tumor, wir hoffen, dass unsere Methode führt zu Patienten und Behandlungen deutlich besser aufeinander abgestimmt. Darüber hinaus gibt es Gelegenheit für kritische biologische Erkenntnisse gemacht werden durch die Erhöhung der Suchraum innerhalb jeder Tumor“, sagt Samra Turajlic, Gruppenleiter am Crick und Berater, Medizinische Onkologie am Royal Marsden.

Durch umfangreiche Tests auf den Fall von Nierenkrebs, das repräsentative sampling-Methode gab identischen genetischen Ergebnisse 95% der Zeit, im Vergleich zu nur 77% Konsistenz mit den aktuellen Methoden. Ebenso in einem Fall von Hautkrebs, die neue Methode korrekt identifiziert, eine komplexe und schwierige Krebs zu behandeln, von Anfang an, in der Erwägung, dass die aktuelle Methode verpasste wichtige genetische Informationen.

„Diese Methode ist genauer, hat mehr reproduzierbare Ergebnisse und hat die gleichen Sequenzierung Kosten als die aktuelle Technik. In der Tat, durch die Einführung einer zusätzlichen, einfachen Reinigung Schritt, es könnte viel billiger, als den vorhandenen Prozess. Es könnte ein gamechanger für Tumor-sampling in Krankenhäusern und in der Forschung“, sagt Kevin Litchfield -, Blei-Autor und Bioinformatiker in der Translationalen Krebs-Therapeutika Labor an der Crick.

„Durch diese Arbeit haben wir angesprochen-ein großes Hindernis für solid tumor-Diagnostik mit einer einfachen Methode, die implementiert werden können in der Klinik“, sagt Nelson Alexander, das Projekt principal investigator bei Roche Molecular Solutions. „Es ist eine großartige demonstration der Auswirkungen von Kooperationen zwischen öffentlichen und privaten Institutionen können auf langjährige Herausforderungen im Gesundheitswesen.“