Enthüllung Krankheit-verursachen von genetischen Veränderungen auf dem Chromosom 17

Potocki-Lupski-Syndrom ist eine Bedingung, die Ergebnisse aus, die eine zusätzliche Kopie der ein kleines Stück des Chromosoms 17, die in jeder Zelle. Eine andere Bedingung, bekannt als Smith-Magenis-Syndrom, Ergebnisse, wenn Sie ein ähnliches kleines Stück des Chromosoms 17 ist gelöscht. Es wurde angenommen, dass diese Bedingungen eingetreten ist, weil das Ungleichgewicht in der genetischen Informationen, die in das geänderte Stück von Chromosom 17, aber ein multidisziplinäres team unter der Leitung von Forschern an Baylor College of Medicine entdeckt, dass zusätzlich zu der Duplikation oder deletion einer chromosomalen region, die eine ganze Gruppe von Genen, umfangreiche single-Watson-Crick-Basenpaar-Mutationen können auftreten, und kann dazu beitragen, die Merkmale der AGB. Die Studie erscheint in der Zeitschrift Cell.

„In einer früheren Studie haben wir vorgeschlagen hatten, dass die beiden Duplikationen und Deletionen ein kleines Stück des Chromosoms 17 und auch single-alle Mutationen aufgetreten in der gleichen Veranstaltung“, sagte co-Erstautor Dr. Claudia M. B. Carvalho Assistenz-professor für molekular-und Humangenetik am Baylor College of Medicine. „Hier haben wir eine Reihe von high-resolution-Technologien und leistungsfähige statistische Analysen bestätigen und erweitern unsere bisherigen Beobachtungen. Um dies zu erreichen, nahmen wir einen genaueren Blick auf die genetischen Veränderungen in diesem kleinen Stück des Chromosoms 17 in einer großen Kohorte von nicht verwandten Patienten mit entweder Potocki-Lupski-oder Smith-Magenis-Syndrom“.

„Wir haben festgestellt, dass die Kohorte können in zwei Gruppen unterteilt werden. Eine Gruppe umfasst Personen, die gemeinsam haben, die gleichen änderungen in der gleichen Gegend der DNA. Wir nennen Sie immer wiederkehrende Veränderungen, weil wir beobachten, rekurrente Deletionen oder Duplikationen des gleichen DNA-Segmenten“, sagte co-Erstautor Dr. Christine R. Beck, ein ehemaliger Postdoc-Stipendiat an das Baylor, ist derzeit assistant professor in der Abteilung von Genetik und Genom-Wissenschaften an der University of Connecticut Health Center und the Jackson Laboratory for Genomic Medicine.

In der zweiten Gruppe, die Forscher nennen es nicht-rezidivierenden, jeder der Patienten hatte ein anderes Muster der DNA-Veränderungen.

„Das Muster der variation innerhalb der nicht-wiederkehrenden-Gruppe ist komplexer als die immer wiederkehrende Gruppe,“ Beck. „Wir schlagen vor, dass die einmaligen und die wiederkehrenden rearrangements auftreten, durch unterschiedliche Mechanismen.“

Die Forscher weiter gegenüber den immer wiederkehrenden und nicht wiederkehrenden Muster bezüglich der Anzahl der DNA-Einzel-Basenpaar-Mutationen. Als Referenz, Sie sind auch im Vergleich der Proben von Patienten mit den jeweiligen Eltern und mit Proben von Personen, die, ohne die Voraussetzungen.

„In den immer wiederkehrenden Gruppe sahen wir nur vier von 19 Patienten mit Mutationen innerhalb dieser Regionen, während in 13 der 26 Patienten in der nicht-wiederkehrenden-Gruppe hatten Mutationen und Sie traten mit einer rate, die 5 bis 50-mal höher“, sagt Carvalho sagte. „Die meisten dieser Mutationen traten innerhalb von Genen. Dies ist wichtig, weil diese Art von Mutationen können zu der Erkrankung beitragen.“

„Unsere statistischen Analysen zeigten, dass die Mutationen wurden völlig neue, in der Patienten — die Eltern nicht tragen. Die Mutationen auch auftreten, zusammen mit den Duplikationen oder Deletionen auf dem gleichen Chromosom 17, und die auftreten können, über lange Strecken dieser region“, sagte co-Autor Dr. Zeynep Coban-Akdemir, ein computer-Wissenschaftler und Genetik und Genomik postdoctoral associate für molekular-und Humangenetik am Baylor.

„Außerdem“, sagte co-Autor Xiaofei Lied, ein student im Aufbaustudium in molekular-und Humangenetik am Baylor, „unseren Analysen festgestellt, dass eine große Anzahl von Mutationen auftreten, um break-Punkte, die Orte auf der DNA, wo Deletionen oder Duplikationen stattfinden, und dass die Mutationen eher die Nähe zu einander.“

Diese Studie eröffnete sich ein Fenster in die Komplexität der genetischen Veränderungen in dieser kleinen region des Chromosoms 17, die dazu führen, diese beiden seltenen Bedingungen, und schlägt vor, dass andere Bedingungen, die beinhalten, Duplikationen oder Deletionen von Chromosom-Abschnitte entstehen, die durch ähnliche Mechanismen.

„Vier Frau, Wissenschaftler, Claudia, Jane, Xiaofei und Christine, aus allen Ecken der Welt (Brasilien, Türkei, China und den USA) knirschte ein erstaunliches Stück Wissenschaft und lehrte uns alle eine Menge auf dem Weg,“, sagte co-entsprechenden Autor Dr. James R. Lupski, Cullen Professor für Molekular-und Humangenetik am Baylor, principal investigator an der Baylor-Hopkins-Center für Mendelian Genomics und der Fakultät der Baylor-Genetik und Genomik-graduate-training-Programm.