Analyse der COVID-19 Genome offenbart große Zahl von Einführungen in das Vereinigte Königreich im März

Etwa 40 Linien der SARS-CoV-2-virus aufgezeichnet wurden, die in der UK, von denen einige bereits ausgestorben, während andere gedeihen. Vorher waren die verschiedenen Linien der einzigen Stamm des virus in den UK durch mehrere Importe aus der ganzen Welt, darunter Europäische Länder wie Spanien, Italien und Frankreich.

Nun, weniger internationale Linien bleiben in Großbritannien, und neue Fälle von COVID-19 ergeben sich aus der lokalen Ausbreitung eher als die Einfuhr aus anderen Ländern. Die Daten, Berichte§, herausgegeben von der COVID-19 Genomik-UK Consortium (COG-UK), zeigen den Wert in der Zuordnung COVID-19-Linien in Großbritannien zu verstehen, wie das virus breitet sich auf nationaler, regionaler und lokaler Ebene.

Als der 22 Mai, mehr als 20.000 virale Genom aus positiv COVID-19 tests wurden sequenziert, die in das Vereinigte Königreich, das ist die größte Anzahl von COVID-19 Genome sequenziert, die ein Land betroffen von der Pandemie.

Diese Genom-Sequenzen generiert werden, und genutzt von Forschern im Rahmen des COG-UK zu identifizieren, die verschiedenen Linien der Viren zirkulieren in Großbritannien. Trotz der jüngsten Berichte, dieser Band für die Sequenzierung bestätigt die alle COVID-19 Fällen in Großbritannien teilen einen letzten gemeinsamen Vorfahren aus China; alle Fälle sind eng miteinander verbunden. Die Linien identifiziert highlight kleine Veränderungen im virus, aktivieren Sie die überwachung und das tracking über die Zeit, aber nicht signal die Entstehung neuer Stämme zu diesem Zeitpunkt in den Ausbruch.

Diese Daten werden Beihilfen der britischen Regierung im Verständnis der Muster der Ausbreitung in Großbritannien zu helfen, den Fokus verschiedene Eingriffe in bestimmte Bereiche des UK, die die Ausbreitung des virus und letztlich Leben retten.

Die COVID-19 Genomik-UK Consortium (COG-UK), bestehend aus den NHS, Öffentliche Gesundheit Agenturen und zahlreiche wissenschaftliche Institutionen und Forschungseinrichtungen—ist die Bereitstellung großer Skala, schnelle Sequenzierung der SARS-CoV-2 virus von positive COVID-19-Beispiele und teilen der Intelligenz mit Krankenhäusern, regionalen NHS-Zentren und der Regierung.

Die neuesten COG-UK-Daten Berichte zeigen eine große Anzahl von unabhängigen Einführung des virus in Großbritannien aus der ganzen Welt, was in etwa 40 COVID-19 Linien, die derzeit oder wurden, zirkulieren in Großbritannien. Allerdings legen die jüngsten Daten nahe neue COVID-19 Fällen in Großbritannien sind infolge lokaler Ausbreitung eher als die Reisenden nach Großbritannien aus anderen Ländern.

Eine dynamische Linie-Zuordnung-Methode, entwickelt innerhalb des Konsortiums, ermöglicht die überwachung des SARS-Cov2 Dynamik im Laufe der Zeit innerhalb der UK, mit Daten und abgebildet geliefert, offen über eine interaktive web-Anwendung.

Die generierten Daten durch COG-UK werden verwendet, um virus-status-Berichte, einschließlich Schätzungen der für die Reproduktion der Anzahl, auf der Ebene von Städten oder Kommunen.

„Durch die Analyse und den Vergleich der verschiedenen Linien der SARS-CoV-2-virus verursacht, dass COVID-19 sehen wir, wie das virus breitet sich durch das Vereinigte Königreich, und festzustellen, ob neue Fälle, die sich aus lokalen Ausbreitung gegen die Einfuhr aus anderen Ländern. Durch laufende Zuordnung der Linien in Raum und Zeit können wir besser verstehen, und reagieren auf die sich verändernde Dynamik der Pandemie“, sagt Professor David Aanensen, Direktor des Centre for Genomic Erreger-Surveillance an der Universität von Oxford Big-Data-Institut.

„Seit dem Start dieses Projekts Ende März dieses Konsortium sequenziert mehr als 20.000 virale Genom aus positiv COVID-19 Proben. Unternehmen, ein Projekt dieser Größenordnung möglich gemacht, von einem tollen Netz von Helfern und unseren Mitarbeitern, die sich beworben haben, Ihre Welt-Klasse-Kompetenz in der Genomik und der überwachung von Infektionskrankheiten zu bekämpfen COVID-19,“ sagt Dr. Cordelia Langford, Leiterin der Wissenschaftlichen Operationen an der Wellcome Sanger Institute.