Erstellung einer globalen Karte der protein-shape-Universum: Roman-mapping-Technik öffnet die Tür zu neuen Einsichten über die Funktionen im Körper

Proteine liefern einen detaillierten Blick ins innere des menschlichen Körpers und wie es schützt sich selbst von vielen Krankheiten. Proteine machen etwa 15% der Körpermasse, sind die am häufigsten vorkommende Feste Stoffe in den menschlichen Körper. Sie sind wichtige arbeiten, Moleküle des Immunsystems, Stoffwechsel -, Gehirn-Funktion, Körper, Bewegung, und ein physikalisch und chemisch funktionellen Teile in einem Körper. Jedes protein hat eine spezifische Funktion unter der Leitung der eigenen gene.

Nun, Purdue University-Forscher haben eine neue Art und Weise zu klassifizieren, Proteine und Ihre Formen, die legt den Grundstein, wie wir verstehen, protein-Strukturen und Funktionen. Die Formen sind wichtig, weil Sie bestimmen die Rolle und Wirksamkeit der Proteine. Die Forschung, veröffentlicht in der April-Ausgabe von PLOS Computational Biology.

„Wir haben eine neue Methode entwickelt, um anzeigen und klassifizieren von protein-3D-Formen, was für unsere grundlegenden Verständnis von protein-Formen und wird zu einer Stiftung von künstlichen protein-design und andere Anwendungen von Proteinen,“ sagte Daisuke Kihara, ein professor von biologischen Wissenschaften und informatik in Purdue College of Science, wer führt das research-team.

Kihara, sagte Proteine wurden konventionell eingestuft Konformationen von protein-Ketten, eine eher detaillierte Ebene der strukturellen Eigenschaften. Sie derzeit klassifizieren, Proteine, die von Ihrer gesamten Oberfläche zu Formen, die mehr direkt relevant sind, wie Sie interagieren mit anderen Proteinen und Substanzen in eine Zelle.

Das Purdue-team ordnet und klassifiziert, der 3D-Oberflächen-Formen der Proteine in einem bestimmten Raum innerhalb des Körpers. Oberfläche Formen der Proteine sind dargestellt mit 3D-Deskriptoren, Zernike, mathematische moment-basierten Invarianten, die zuvor gezeigt, wirksam für biomolekulare Struktur ähnlichkeit suchen.

Sie haben auch analysiert, die Form Raum besetzt durch protein-komplexe. Das mapping liefert Daten, die in der Beziehung zwischen den Formen, main-Kette faltet sich und Komplexbildung.

„Diese Arbeit ist im Bereich der Bioinformatik,“ Kihara sagte. „Die Bioinformatik ist nicht nur nützlich für die Verarbeitung von biologischen Daten oder die Entwicklung von computergestützten tools, aber es ist auch nützlich für die Bereitstellung einer einmaligen Aussicht und dem Rahmen, können ändern, wie Menschen sehen und verstehen, die biomolekulare Welt.“

Kihara hat, arbeitete mit den Purdue Research Foundation, Office of Technology Commercialization auf einige seiner Forschung und Technologie.